Villamaría goza de gran biodiversidad debido a su topografía y cultivos.
En la zona rural se identifican doce senderos ecológicos con la variedad temática natural, estos senderos permiten variedad de forma de movilización, prefiriendo la caminata y la cabalgata.En el paisaje de la zona cafetera es común encontrar tradicionales cafetales ya que las plantaciones de café son figurativas en este municipio.
Entre las variedades de sus montañas encontramos las especies Yarumo, Verdes Chilcos, Dragos, algunas palmas de cera y hermosas cascadas.
El sendero ecológico mas representativo es el Parque Nacional Natural Los Nevados.
Villamaría cuenta con gran variedad de senderos ecológicos, los mas importantes son:
-Alto del Portón.
-De las Tapias.
-Cinco Puentes.
-Del Sector Alquería.
-La Capilla del Arroyo.
-De los Túneles.
